ปกติก็การดูแลฟลูททั่วไปทำได้อย่างงง่ายเพียงแค่ล้างมือให้สะอาดก่อนจับฟลูตขึ้นมาซ้อมหรือเป่าในแต่ละวัน หลังเป่าเสร็จนำผ้าสะอาดเช็คไม่ให้มีน้ำบริเวณด้านในของตัวเครื่อง 

ส่วนด้านนอกของตัวเครื่องใช้ผ้าสำหรับทำความสะอาดฟลูตเช็ดรอยนิ้วมือรอบๆตัวเครื่อง กรณีที่ไม่ได้ผ้าสำหรับฟลูทเช็ดอาจทำให้เกิดรอยลักษณะคล้ายขนแมวบนเครื่อง เวลาเช็ดควรระวังบริเวณคีย์(Key)เพราะหากไม่ระวังอาจทำให้เกิดความเสียหายต่อนวม(Pad) 

ส่วนหัวเป่า(HeadJoint)สามารถล้างน้ำได้ควรล้างอาทิตย์ละครั้ง เฉพาะส่วนหัวเท่านั้น หลังจากนั้นเช็ดหรือวางทิ้งไว้ในที่ร่ม มีอากาศถ่ายเท เมื่อแห้งแล้วจึงเก็บใส่กล่อง 

ขณะใช้ฟลุทก็ถือระวังๆอย่าให้ตกหรือไปกระแทกอะไร ถ้าไม่ใช้ก็เก็บใส่กล่องหรือวางไว้กับขาตั้งสำหรับฟลูท